生物学者が選んだ微生物群落分析によく用いられる31種類の炭素源は、国際的な微生物生態機能多様性研究の比較典型的かつ権威的な方法の1つ。各ブロック96穴ECOプレート上には3組の平行、1組31種の炭素源、3個の陰性対照があり、同じサンプルを添加すると、3組の平行データを得ることができる。31種類の炭素源に対する微生物群落の特徴的な利用この微生物群落の代謝指紋パターンと呼ばれる。単一のマイクロプレート上の指紋パターンから大量の代謝情報を得ることができる。純種及び混合菌群（例えば土壌サンプル）の微生物機能多様性研究に用いることができる。

米国BIOLOG社が開発した製品ECOボードは、特に微生物群落分析と生態研究のために設計されており、Ecoボードには国際土壌微生物学者が精選した微生物群落分析のためによく使われる31種類の炭素源が含まれている。

96ウェルECOプレート1枚に3組の平行、31種類の炭素源、3つの陰性対照があり、同じサンプルを添加すると、3組の平行データを得ることができる。31種類の炭素源に対する微生物群落の特徴的な利用この微生物群落の代謝指紋パターンと呼ばれる。単一のマイクロプレート上の指紋パターンから大量の代謝情報を得ることができる。純種及び混合菌群（例えば土壌サンプル）の微生物機能多様性研究に用いることができる。

31種類の炭素源は6つの種類に分けることができ、具体的には以下の通り：

単糖/グリコシド/重合糖類

B 2，D-キシロース

H 1，a-D-ラクトース

A2,？-メチルD-グルコシド

G2,グルコース−1−リン酸塩

E 1，a−環状デキストリン

F1,ヘパリン

G 1，D-フィブリンジオース

アミノ酸類、

A 4、L-アルギニン、

B 4，L-アスパラギン酸

C 4 L-フェニルアラニン

D 4，L-セリン

E 4，L-トレオニン

F4，グリシル-L-グルタミン酸

エステル類

B1,ピルビン酸メチル

C1,トウェイン40

D1,トウェイン80

A 3，D-ガラクトース酸γラクトン

アルコール類

C 2，I-エリスリトール

D 2，D-マンニトール

H 2，D，L-a-グリセリン

アミン類

G4,フェニルエチルアミン

H4,フミン

E 2，N−アセチル−D−グルタミン

さんるい

B 3，D-ガラクトースアルデヒド酸

F 2 D-グルコサミン酸

C3,2−ヒドロキシ安息香酸

D3,4−ヒドロキシ安息香酸

E 3，r-ヒドロキシ酪酸

F3,イタコン酸

G 3，a-ブタノン酸

H 3，D-リンゴ酸

サンプルを簡単に処理した後（ろ過または遠心分離）、上澄み液を取ってECO板に加えて5日間以上培養し、一定時間ごとに酵素スケールで590 nmと750 nmでOD値を測定し、OD値の大きさ反応サンプル微生物はある炭素源基質の能力を利用して、OD値を導出した後に分析を行い、例えばAWCD値（平均吸光度）、豊かさ、単孔の動力学分析、異なる炭素源の比較など、クラスターソフトウェアを用いて異なるサンプルに対してクラスター分析を行った。

特筆すべきはECOプレートは培養可能微生物を測定するだけでなく、一部の培養不可微生物を測定することができ、微生物が炭素源を利用して代謝することができれば（増殖しない）、ECOプレート上の発色系はすべて検出することができる。

比較的によく見られる応用はECO板を用いて環境要素、根系、葉面、肥料、農薬が土壌微生物菌群の生態機能多様性に与える影響を分析し、異なるサンプル間または同一サンプルの異なる時間の機能多様性の違いを比較し、環境修復前後の微生物群落の機能多様性の違いを比較する、などである。